师资队伍

首页  师资队伍  教师信息  植物学系

刘红军

发布时间:2022-06-21浏览次数:16071

学历

博士

职称

教授

所属部门

植物学系

招生专业

发育生物学（硕士、博士、博士后）

联系方式

电话: 0538-8242285   E-mail: HongjunL@sdau.edu.cn

个人简介

 刘红军，男，1981年8月出生，黑龙江省友谊县人。博士、教授、博士生导师。崖州湾国家实验室玉米团队主任科学家，“泰山学者”青年专家。2005年和2008年在东北农业大学获得学士和硕士学位；2008年7月-2009年9月在中国农业科学院作物科学研究所（国家玉米产业技术体系首席办公室）工作；2009年9月-2013年7月于四川农业大学玉米研究所攻读玉米分子遗传博士学位，期间2010年9月-2012年9月，2013年7月-2013年12月受国家留学基金委和四川农业大学资助在美国爱荷华州立大学Thomas Lübberstedt教授课题组从事玉米分子遗传研究；2014年1月-2016年9月在中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所巫永睿研究员课题组从事博士后研究工作；2016年9月到山东农业大学生命科学学院工作，加入作物生物学国家重点实验室作物发育分子生物学研究团队。在PNAS、Plant Biotechnology Journal、the Plant Journal、Plant Physiology和 Communications Biology等国际期刊上发表论文23篇。主持国家自然科学基金面上项目3项、生物育种-2030、十四五耐盐碱专项、山东省泰山学者工程人才项目1项、人才培育科研项目1项、山东省自然科学基金面上项目2项，山东农业大学人才引进启动项目1项，累计到账经费500万元。申请专利6项，参与审定国审玉米新品种“爱农707”1个，参编科学出版社及Studium出版社著作2项。

现为中国作物学会、遗传学会、美国遗传学会及植物学会会员；TAG，Plant Physiology, BMC Genomics, BMC Plant Biology及Frontiers in Plant Science等杂志审稿专家；国家自然科学基金评审专家；国家留学基金委评审专家。目前指导博士研究生4人，硕士研究生10人，已毕业研究生10人。

教学工作

承担本科生《植物学》和《植物学实验》等课程的年度教学工作。

研究方向

 玉米是我国重要的粮食、饲料和经济作物，是国家重要的战略保障物资。世界级种业巨头公司（先锋及孟山都）其核心的产业链即为玉米商业育种。近年来，高温、干旱、肥料过量施用和雾霾等一系列恶劣环境因子为玉米高产提出了严峻的考验，如何培育出高产优质多抗的玉米新品种成为基础科研领域和育种家的研究热点和难点。本实验室重点围绕玉米生殖发育过程中，感知外界环境所形成的一系列表型变化，结合正向遗传学和反向遗传学手段，筛选和构建一系列突变体和遗传作图群体，利用分子生物学、生物化学、组学和遗传统计模型，解析玉米生殖发育过程中关键基因的表达作用模式和遗传网络调控机制。主要包括：

 玉米是我国重要的粮食、饲料和经济作物，是国家重要的战略保障物资。世界级种业巨头公司（先锋及孟山都）其核心的产业链即为玉米商业育种。近年来，高温、干旱、肥料过量施用和雾霾等一系列恶劣环境因子为玉米高产提出了严峻的考验，如何培育出高产优质多抗的玉米新品种成为基础科研领域和育种家的研究热点和难点。本人重点围绕玉米籽粒发育和杂种优势利用，感知外界环境所形成的一系列表型变化，结合正向遗传学和反向遗传学手段，筛选和构建一系列突变体和遗传作图群体，利用分子生物学、生物化学、组学和遗传统计模型，解析玉米籽粒发育和杂种优势生物学过程中关键基因的表达作用模式和遗传网络调控机制。主要包括：

 （1）玉米籽粒发育突变体筛选和克隆。利用正向和反向遗传学，在大刍草、B73、W22、黄早四等骨干自交系背景上构建和筛选EMS、Mu类突变体，结合经典基因克隆技术图位克隆候选基因，解析玉米生殖发育过程中关键基因的遗传调控网络和作用机制；

（2）玉米杂种优势机理及分子标记辅助育种（MAS）探索和开发。构建杂种优势机理探索的遗传群体，结合本课题组现有的遗传定位群体和连锁关联群体，解析玉米杂种优势形成过程中的遗传作用模式和分子生物学功能；开发关键基因的功能标记，进行分子标记辅助育种和全基因组选择育种探索工作；

科研项目

  1. 科技创新2030“农业生物育种”重大项目子任务，2023ZD040680407，杂种优势新基因挖掘与育种价值评价，2023.12~2025.12，56万元、在研、主持；

  2. 国家重点研发专项子任务，2022YFD1201701，作物种质资源耐盐碱和养分高效利用性状的精准鉴定，2022.12~2027.11，80万元、在研、主持；

  3. 国家自然科学基金委员会，面上项目，32472176, 玉米硬质胚乳突变体sve2的图位克隆和理想粒型创制，2025.01~2028.12、50万元、在研、主持；

  4. 国家自然科学基金委员会，面上项目，32072009, 玉米百粒重主效QTL（Hgw1q1）克隆及分子机理解析，2021.01~2024.12、58万元、已结题、主持；

  5. 国家自然科学基金委员会，面上项目，31771799, 玉米醇溶蛋白基因染色体重排和拷贝数变化的遗传解析，2018.01~2021.12、59万元、已结题、主持；

  6. 山东省自然科学基金委员会，面上项目，ZR2017MC017, 玉米褐色叶中脉突变体基因家族调控网络和品质性状遗传改良，2017.08~2020.06、17万元、已结题、主持；

  7. 山东省自然科学基金委员会，面上项目，ZR2025MS290, 早期玉米胚乳和种皮分化中染色质可及性动态变化机制解析，2025.07~2028.06、10万元、在研、主持；

  8. 山东省一流学科建设“811”，2024.07~2025.12，100万元，在研，主持；

  9. 山东省政府，泰山学者工程，23943, 优质蛋白玉米基因组结构变异遗传解析，2019.01~2023.12、100万元、已结题、主持；

  10. 山东农业大学，引进人才启动经费，72127，玉米籽粒发育，2016.09~2021.09、80万元、已结题、主持；

研究专利

1. 沈亚欧; 杨珊; 林海建; 刘红军; 缪林; 潘光堂; 一种新型的转基因专用茎尖分生组织培养皿，2013-05-27，中国，ZL 2013 2 0295177.X.

2. 巫永睿; 刘红军;孙传龙；功能连锁标记0707-1及其在玉米种质改良中的应用，2020.10.27，中国，ZL 2016 1 0133152.8.

发表论文

  1. Zhang Mingyue†, Li Xiaohan†……Thomas Lübberstedt, Zhang Xiansheng*, Yang Xuerong*, Zhou Chao*, Liu Hongjun*. Modulation of lignin and anthocyanin homeostasis by GTP cyclohydrolase1 in maize. Plant Biotechnology Journal, 2025, 23(7):2449-2463. (1区，IF=12.6, 引用0次)

  2. Li Mengyao†, Fan Xiaoxing†, Li Xiaohan†……Shi Junpeng*, Wang Jiechen*, Liu Hongjun*. Uncovering chromatin accessibility dynamics in early maize endosperm and seed coat differentiation. the Plant Journal, 2025, 123(2):e70316. (1区，IF=6.2, 引用0次)

  3. Kang Congbin†, Zhang Lin†……Zhao Xiang Yu, Zhang Xian Sheng, Lübberstedt Thomas, Yang Xuerong*, Liu Hongjun*. Polymerization of beneficial plant height QTLs to develop superior lines which can achieving hybrid performance levels. Molecular Breeding, 2025, 45(2). (3区，IF=3.1，引用0次)

  4. Liu Yuting†, Gao Xiang, Liu Hongjun, Yang Xuerong, Liu Xiao, Xu Fang, Zhu Yuzhi, Li Qingyun, Huang Liangliang, Yang Fang, Lai Jinsheng, Shi Junpeng. Constraint of accessible chromatins maps regulatory loci involved in maize speciation and domestication. Nature Communications, 2025, 1(16): 2477. (1区，IF=14.7，引用2次)

  5. Kong Qianqian†, Jiang Yi†, Sun Mingfei†……Yang Xuerong, Song Xinyuan, Liu Hongjun*, Shi Junpeng*. Biparental graph strategy to represent and analyze hybrid plant genomes. Plant Physiology, 2024, 196(2):1284-1297. (1区，IF=6.6，引用1次)

  6. Sun Mingfei†, Pu Menglin†, Zheng Guangming†……Zhang Xiansheng, Yang Xuerong, Liu Hongjun*, Zhou Chao*. Enhanced antioxidant activity improves deep-sowing tolerance in maize. BMC Plant Biology, 2024, 24(1):1229. (2区，IF=5.26，引用1次)

  7. Huang Yongcai†, Wang Haihai, † Zhu Yidong, Huang Xing, Li Shuai, Wu Xingguo, Zhao Yao, Bao Zhigui, Qin Li, Jin Yongbo, Cui Yahui, Ma Guangjin, Xiao Qiao, Wang Qiong, Wang Jiechen, Yang Xuerong, Liu Hongjun, Lu Xiaoduo, Brian A. Larkins, Wang Wenqin*, Wu Yongrui*. THP9 enhances seed protein content and nitrogen-use efficiency in maize, Nature, 2022, 612(7939): 292-300. (1区，IF=41.584，引用116次)

  8. Wang Qin, Fan Jiongjiong, Cong Jia, Chen Mengjiao, Qiu Jie, Liu Jie, Zhao Xiaoyan, Huang Ruipeng, Liu Hongjun, Huang Xuehui*. Natural variation of ZmLNG1 alters organ shapes in maize, New Phytologist, 2022, 237(2): 471-482. (1区，IF=10.151，引用6次)

  9. Liu Hongjun†, Wang Qin†……Lai Jinsheng, Zhang XianSheng* and Huang Xuehui*. Genome-wide identification and analysis of heterotic loci in three maize hybrids. Plant Biotechnology Journal, 2020, 18(1):185–194. (1区，IF=12.6，引用24次)

  10. Li Changsheng†, Xiang Xiaoli†……Liu Hongjun…… Wu Yongrui* and Wang Wenqin*. Long-read sequencing reveals genomic structural variations that underlie creation of quality protein maize. Nature Communications, 2020, 11: 17. (1区，IF=17.694，引用67次)

  11. Liu Hongjun†, Huang Yongcai†, Li Xiaohan†…… David R. Holding and Wu Yongrui*. High frequency DNA rearrangement at qγ27 creates a novel allele for Quality Protein Maize breeding. Communications Biology, 2019, 2: 460. (1区，IF=6.268，引用8次)

  12. Ignacio Trucillo Silva†, Hari Kishan R. Abbaraju, Lynne P. Fallis, Liu Hongjun, Michael Lee* and Kanwarpal S. Dhugga*. Biochemical and genetic analyses of N metabolism in maize testcross seedlings: 2. Roots. Theoretical and Applied Genetics, 2018, 131(6):1191-12. (1区，IF=5.574，引用15次)

  13. Liu Hongjun†, Ma Langlang†, Yang Xuerong†……Wu Yongrui and Shen Yaou*. Integrative analyses of DNA methylation, mRNA, and small RNA during dedifferentiation of maize embryo. BMC Plant Biology, 2017, 17(1):105. (2区，IF=5.26，引用20次)

  14. Liu Hongjun†, Zhang Lin †……Michael Lee, Thomas Lübberstedt and Zhao Guangwu*. Quantitative trait locus analysis for deep-sowing germination ability in the maize IBM Syn10 DH population. Frontiers in Plant Science, 2017, 8:813. (2区，IF=6.627，引用52次)

  15. Liu Sanzhen†*, Zheng Jun†, Pierre Migeon†, Ren Jie, Hu Ying, He Cheng, Liu Hongjun…… Wang Guoying*. Unbiased K-mer analyses reveal marked changes in copy number of highly repetitive sequences during maize domestication and improvement. Scientific Reports, 2017, 7:42444. (3区，IF=4.525，引用20次)

  16. Liu Hongjun†, Shi Junpeng†……Han Bin, Lai Jinsheng and Wu Yongrui*. Gene duplication confers enhanced expression of 27-kDa γ-zein for endosperm modification in quality protein maize. PNAS, 2016, 113(18):201601352.(1区，IF=9.661，引用65次)

  17. Ignacio Trucillo Silva†, Hari Kishan R. Abbaraju, Lynne P. Fallis, Liu Hongjun, Michael Lee* and Kanwarpal S. Dhugga*. Biochemical and genetic analyses of N metabolism in maize testcross seedlings: 1. Leaves. Theoretical and Applied Genetics, 2017, 130(7):1453-1466. (1区，IF=5.574，引用13次)

  18. Liu Hongjun†, Yang Xuerong†, Liao Xinhui†……Zhang Zhiming* and Pan Guangtang*. Genome-wide comparative analysis of digital gene expression tag profiles during maize ear development. Genomics, 2015, 106(1):52-60. (3区，IF=6.205，引用14次)

  19. Liu Hongjun†, Niu Yongchao†, Pedro J. Gonzalez-Portilla†, Zhou Huangkai†……Doreen Ware, Zhang Zhiming*, Thomas Lübberstedt* and Pan Guangtang*. An ultra-high-density map as a community resource for discerning the genetic basis of quantitative traits in maize. BMC Genomics, 2015, 16(1):1078. (2区，IF=4.547，引用51次)

  20. Liu Hongjun†, Zhou Huangkai†, Wu Yongsheng†……Thomas Lübberstedt and Pan Guangtang*. The impact of genetic relationship and linkage disequilibrium on genomic selection. PloS One, 2015, 10(7):e0132379. (3区，IF=3.24，引用44次)

  21. Liu Hongjun †, Qin Cheng †, Chen Zhe †…… Zhang Zhiming* and Pan Guangtang*. Identification of miRNAs and their target genes in developing maize ears by combined small RNA and degradome sequencing. BMC Genomics, 2014, 15:25. (2区，IF=4.547，引用103次)

  22. Constantin Jansen†, Zhang Yongzhong†*,·Liu Hongjun†, Pedro J. Gonzalez Portilla†,·……Thomas Lübberstedt*. Genetic and agronomic assessment of cob traits in corn under low and normal nitrogen management conditions. Theoretical and Applied Genetics, 2015, 128(7):1231-1242.(Co-first author). (1区，IF=5.574，引用17次).

  23. Yin Fuqiang†, Qin Cheng†, Gao Jian†, Liu Ming, Luo Xirong, Zhang Wenyou, Liu Hongjun……Pan Guangtang*. Genome-wide identification and analysis of drought-responsive genes and microRNAs in tobacco. IJMS, 2015, 16(3):5714-5740. (2区，IF=6.208，引用36次)

著作教材

1. 陈泽辉，刘文欣，雍红军，刘红军，陈绍江. 2019, 玉米育种的数量遗传学, 科学出版社.

2. Yongsheng Wu, Ursulak Frei, Hongjun Liu, Gerld De La Fuente, Kaijian Huang, Yuanwen Wei and Thomas Lübberstedt. Combining Genomic Selection and Doubled Haploid Technology Increases Efficiency of Maize Breeding. Biotechnology Volume2 plant breeding. 2014, ISSN:1-62699-015-8


本课题组依托作物学国家重点实验室平台，结合玉米种业关注的科学问题开展研究，团队拥有丰富的分子遗传和功能基因组研究基础，欢迎有志之士报考本课题组研究生（硕士、博士）和从事博士后研究工作，为未来玉米产业添砖加瓦！联系方式：HongjunL@sdau.edu.cn